Detailed information of deep learning profile BP001264.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCFL in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: CTCFL
Model ID: BP001264.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1102.3
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8NI51  
Source: ENCSR000BNK
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.01 0.00 0.06 0.10 0.00 0.03 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.06 -0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.10 0.06 0.05 0.10 0.07 0.00 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2892 2739 2597 2919 3622 2988 2271 2674 2138 2392 2773 2745 2632 2668 2648 2095 2954 3162 858 364 7086 1091 2263 12067 45 3418 971 115 337 1872 3344 1192 2236 3973 2238 3585 2435 2718 2872 2920 2938 3201 2708 2956 2950 3170 2922 2998 2892 2870 ]
C [ 4399 4079 4556 5243 3893 3787 3941 4012 7198 6172 5392 5236 4886 4826 4708 5582 4148 2535 12297 14020 1237 8143 6963 575 32 151 797 222 729 11759 1351 8254 6018 4184 3961 3661 4031 4821 5156 5456 4905 4073 4540 4275 4253 4193 4319 4401 4489 4504 ]
G [ 4565 4890 4670 3737 4526 4577 4194 4641 2846 3138 3777 4061 4024 3754 4296 3643 5487 6243 1077 188 3931 5188 1366 1270 14590 10979 10337 14176 12918 467 9083 3651 2021 4579 4314 4272 5714 4461 4148 3546 3996 4541 4720 4673 4638 4434 4535 4561 4482 4573 ]
T [ 2834 2982 2867 2791 2649 3338 4284 3363 2508 2988 2748 2648 3148 3442 3038 3370 2101 2750 458 118 2436 268 4098 778 23 142 2585 177 706 592 912 1593 4415 1954 4177 3172 2510 2690 2514 2768 2851 2875 2722 2786 2849 2893 2914 2730 2827 2743 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.03 0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.04 0.02 -0.04 -0.05 -0.04 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 ]
C [ 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.07 0.10 0.01 0.06 0.03 -0.01 -0.01 -0.04 0.00 -0.02 -0.02 0.07 -0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.00 0.02 0.02 0.02 -0.01 -0.02 0.04 0.02 -0.01 0.02 0.10 0.08 0.06 0.10 0.08 -0.01 0.07 0.01 -0.01 0.01 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.02 -0.00 -0.04 -0.05 -0.01 -0.04 0.04 -0.01 -0.03 -0.05 -0.00 -0.03 -0.01 -0.03 -0.03 -0.00 0.01 -0.01 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1841

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 1158

CWM

PFM

     

HCWM