Detailed information of deep learning profile BP001255.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF257 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF257
Model ID: BP001255.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1710.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9Y2Q1  
Source: ENCSR492FKD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.03 0.02 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 400 320 370 399 423 343 391 364 353 379 378 345 344 366 367 365 387 337 329 296 284 382 429 217 503 65 244 59 25 109 29 82 220 104 647 400 424 337 381 379 333 380 344 460 413 423 430 378 351 393 ]
C [ 599 733 653 586 601 629 605 662 655 669 698 658 707 663 628 669 648 719 725 757 800 782 507 296 783 711 1525 57 394 25 1912 1749 33 1735 514 478 643 692 546 642 646 610 600 552 609 594 596 541 623 577 ]
G [ 458 476 462 496 496 559 492 496 522 461 435 504 464 467 484 464 476 483 455 414 408 330 422 1128 276 405 146 23 216 1503 4 37 158 63 208 548 503 360 469 463 557 519 526 500 515 471 470 537 517 485 ]
T [ 507 435 479 483 444 433 476 442 434 455 453 457 449 468 485 466 453 425 455 497 472 470 606 323 402 783 49 1825 1329 327 19 96 1553 62 595 538 394 575 568 480 428 455 494 452 427 476 468 508 473 509 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.02 0.00 -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.02 -0.01 0.01 -0.03 0.03 0.02 -0.02 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 -0.00 0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.02 0.03 0.02 0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1154

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 404

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 78