Detailed information of deep learning profile BP001248.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZBTB6 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZBTB6
Model ID: BP001248.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1581.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15916  
Source: ENCSR619OUC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 1994 1942 2333 1984 2006 2075 2484 1913 2706 2097 2366 2282 2628 2091 2460 1705 1818 2055 464 6 0 2 1621 8782 194 1777 4913 663 1343 1469 2579 1909 1995 2215 1870 2255 2054 2799 2239 2142 2188 2087 2747 2055 2119 2174 2012 2107 2273 2052 ]
C [ 3378 3565 3107 3136 3230 3284 3048 3256 3172 3992 3617 3161 3171 3480 3316 4284 3240 1154 515 11004 1 10987 5741 252 527 6400 930 5954 6680 4386 3477 3101 3522 4144 3502 2981 2932 3359 2955 3266 3401 4120 3176 3419 3210 3192 3429 3809 3080 4023 ]
G [ 2835 2718 2623 3040 3084 3428 2863 3720 2903 2597 2960 3363 3108 3385 2564 3063 2240 6454 8966 0 87 35 250 1801 6050 2261 3206 539 1377 2113 2456 3657 3332 2480 2568 3507 4050 2769 3566 2796 3401 2728 2723 3431 2664 3509 3456 2726 3240 2752 ]
T [ 2817 2799 2961 2864 2704 2237 2629 2135 2243 2338 2081 2218 2117 2068 2684 1972 3726 1361 1079 14 10936 0 3412 189 4253 586 1975 3868 1624 3056 2512 2357 2175 2185 3084 2281 1988 2097 2264 2820 2034 2089 2378 2119 3031 2149 2127 2382 2431 2197 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.03 -0.02 0.00 0.03 -0.02 0.01 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.02 0.05 -0.03 0.05 0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.03 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.02 0.03 -0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.01 0.02 -0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.05 -0.03 0.02 -0.02 0.02 -0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 410

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 153

CWM

PFM

     

HCWM