Detailed information of deep learning profile BP001248.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZBTB6 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZBTB6
Model ID: BP001248.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1581.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15916  
Source: ENCSR619OUC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2197 2431 2382 2127 2149 3031 2119 2378 2089 2034 2820 2264 2097 1988 2281 3084 2185 2175 2357 2512 3056 1624 3868 1975 586 4253 189 3412 0 10936 14 1079 1361 3726 1972 2684 2068 2117 2218 2081 2338 2243 2135 2629 2237 2704 2864 2961 2799 2817 ]
C [ 2752 3240 2726 3456 3509 2664 3431 2723 2728 3401 2796 3566 2769 4050 3507 2568 2480 3332 3657 2456 2113 1377 539 3206 2261 6050 1801 250 35 87 0 8966 6454 2240 3063 2564 3385 3108 3363 2960 2597 2903 3720 2863 3428 3084 3040 2623 2718 2835 ]
G [ 4023 3080 3809 3429 3192 3210 3419 3176 4120 3401 3266 2955 3359 2932 2981 3502 4144 3522 3101 3477 4386 6680 5954 930 6400 527 252 5741 10987 1 11004 515 1154 3240 4284 3316 3480 3171 3161 3617 3992 3172 3256 3048 3284 3230 3136 3107 3565 3378 ]
T [ 2052 2273 2107 2012 2174 2119 2055 2747 2087 2188 2142 2239 2799 2054 2255 1870 2215 1995 1909 2579 1469 1343 663 4913 1777 194 8782 1621 2 0 6 464 2055 1818 1705 2460 2091 2628 2282 2366 2097 2706 1913 2484 2075 2006 1984 2333 1942 1994 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.01 0.02 -0.02 0.02 -0.03 0.05 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.02 0.02 -0.01 0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.03 0.03 0.02 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.03 0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.05 -0.03 0.05 -0.02 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.01 -0.02 0.03 0.00 -0.02 -0.03 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 410

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 153

CWM

PFM

     

HCWM