Detailed information of deep learning profile BP001247.1

  1. Home
  2. Deep Learning Profile > BP001247.1
This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for BHLHA15 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: BHLHA15
Model ID: BP001247.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: Basic helix-loop-helix factors (bHLH)
Family: Tal-related
JASPAR ID: MA0607.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q7RTS1  
Source: ENCSR888QFJ
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

 

Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 153 162 130 146 142 137 155 162 149 140 132 149 132 149 149 159 183 146 178 157 168 131 310 173 0 702 0 606 0 0 0 101 131 145 116 162 165 168 118 154 151 132 144 132 151 164 119 149 121 159 ]
C [ 196 198 215 202 187 196 203 190 202 180 226 207 235 202 185 230 206 218 174 180 187 227 108 468 704 0 42 24 17 1 24 310 214 204 231 189 176 192 198 183 215 218 210 207 208 194 218 197 225 220 ]
G [ 244 210 210 200 223 221 192 218 218 251 202 197 196 191 231 183 179 190 212 259 229 258 177 60 0 2 433 72 2 703 604 60 229 203 211 193 213 196 240 236 204 210 206 207 192 209 196 209 207 191 ]
T [ 111 134 149 156 152 150 154 134 135 133 144 151 141 162 139 132 136 150 140 108 120 88 109 3 0 0 229 2 685 0 76 233 130 152 146 160 150 148 148 131 134 144 144 158 153 137 171 149 151 134 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 1849

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 689

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 205

CWM

PFM

     

HCWM