JASPAR - ZNF263 - BP001075.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF263 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name:	ZNF263
Model ID:	BP001075.1
Cell line/tissue:	K562
Class:	C2H2 zinc finger factors
Family:	More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID:	MA0528.3
Taxon:	Vertebrates
Species:	Homo sapiens
Data Type:	ChIP-seq
Uniprot ID:	O14978
Source:	ENCSR000EWN
Model:	BPNet
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Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Number of seqlets: 703

Contribution weight matrix (CWM)

A [	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	-0.00	]
C [	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	]
G [	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	]
T [	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.01	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.02	-0.00	0.00	0.02	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.01	-0.00	-0.00	0.01	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	0.00	-0.00	-0.00	]

Frequency matrix

A [	52	55	71	49	55	53	51	41	52	44	39	45	26	46	36	45	14	6	6	11	17	3	7	34	19	65	58	32	43	47	28	39	34	24	29	54	47	58	60	50	49	52	49	61	62	52	62	78	61	61	]
C [	443	433	192	467	444	196	475	481	165	506	520	144	547	347	247	559	539	24	645	668	26	673	673	253	563	398	144	527	519	114	565	540	142	561	493	189	459	467	198	441	409	225	424	406	218	440	420	242	389	403	]
G [	104	72	75	88	70	62	72	71	48	67	44	46	69	60	54	61	82	12	32	11	3	4	8	15	29	45	60	73	42	41	43	34	40	41	51	57	79	68	86	76	97	83	91	90	93	92	87	87	118	103	]
T [	104	143	365	99	134	392	105	110	438	86	100	468	61	250	366	38	68	661	20	13	657	23	15	401	92	195	441	71	99	501	67	90	487	77	130	403	118	110	359	136	148	343	139	146	330	119	134	296	135	136	]

Hypothetical CWM

A [	-0.01	-0.01	-0.02	-0.01	-0.02	-0.02	-0.01	-0.02	-0.02	-0.01	-0.02	-0.02	-0.01	-0.02	-0.03	-0.01	-0.03	-0.04	-0.02	-0.02	-0.04	-0.02	-0.03	-0.03	-0.01	-0.02	-0.03	-0.01	-0.02	-0.03	-0.02	-0.02	-0.03	-0.02	-0.02	-0.02	-0.01	-0.02	-0.02	-0.01	-0.01	-0.02	-0.01	-0.01	-0.02	-0.01	-0.01	-0.01	-0.01	-0.01	]
C [	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	]
G [	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	-0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	]
T [	-0.02	-0.01	-0.00	-0.02	-0.01	0.00	-0.02	-0.01	0.00	-0.03	-0.01	0.00	-0.03	-0.01	0.00	-0.03	-0.02	0.02	-0.04	-0.03	0.02	-0.03	-0.02	0.00	-0.02	-0.01	0.00	-0.03	-0.02	0.01	-0.03	-0.02	0.00	-0.02	-0.01	0.00	-0.02	-0.01	-0.00	-0.02	-0.01	-0.00	-0.01	-0.01	-0.00	-0.01	-0.01	-0.00	-0.01	-0.01	]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 3364

CWM

PFM

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 80

CWM

PFM

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 64

CWM

PFM

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 40

CWM

PFM

HCWM

4 profiles found for the same TF (ZNF263) in other cell types/tissues

Model ID	Name	Data Source	Cell line/tissue	Species	JASPAR ID
BP001074.1	ZNF263	ENCSR000EVD	HEK293	Homo sapiens	MA0528.3
BP001076.1	ZNF263	ENCSR156JWW	WTC11	Homo sapiens	MA0528.3
BP001077.1	ZNF263	ENCSR313MMD	HepG2	Homo sapiens	MA0528.3
BP001078.1	ZNF263	ENCSR845GGY	K562	Homo sapiens	MA0528.3